Según el Art. 2 de su Reglamento Interno (RD 2837/15), el IDICER tiene como objetivos y funciones fundamentales:
• Fomentar y realizar estudios e investigaciones científicas y/o tecnológicas en el campo de la inmunología clínica y experimental.
• Elaborar y ejecutar proyectos de investigación básica y aplicada.
• Contribuir a la formación de RRHH de excelencia en su campo disciplinar.
• Desarrollar acciones de transferencia y difusión de los conocimientos generados.